黄巾贼作乱，右中郎将朱俊任孙坚为佐军司马。孙坚作战勇猛，身先士卒，所向无敌。朱俊为孙坚请功，封别部司马。
中平三年，司空张温暂代车骑将军，率军前往讨伐边章、韩遂，请孙坚做自己的军事参谋。
张温命令董卓前来见自己，结果董卓傲慢，许久不来。孙坚说董卓轻慢上官、讨贼不利、傲慢自负应当斩杀，而张温不允。
孙坚离开张温，回洛阳任议郎。当时长沙贼区（ōu）星作乱，自称将军。朝廷派孙坚任长沙太守，讨伐区星。
孙坚到任之后，亲自率军出战，指挥方略，一个月就击破区星。周朝、郭石等人在零陵、桂阳作乱，孙坚直接率军跨辖区征讨。从此以后，三郡太平无事。
朝廷算孙坚前后功劳，封乌程侯。
灵帝驾崩，董卓祸乱朝纲，荼毒百姓，各州郡纷纷举兵讨伐，孙坚也从长沙出兵，向洛阳开去。
当时的荆州刺史王睿在孙坚面前向来无礼，认为孙坚只是个武夫，很瞧不起。
孙坚对王睿一直怀恨在心，但是又没办法。现在董卓乱国，孙坚看到朝廷无力管辖州郡，便大着胆子杀了王睿。