君父皆亡，使郑成功的病更加严重了。这时又发生了一件令郑成功无法忍受的丑闻，就是他生平最痛恨的通奸、乱伦之类的事情。
原来，郑成功的大儿子郑经给他生了一个孙子，取名为克臧。郑成功知道自己有了孙子，非常高兴。可是不久后他竟得知，孙子并不是郑经的原配夫人所生，而是郑经和郑家的乳母陈氏私通而生的。
郑成功是一个道德观念非常强的人，他曾经颁布过一道命令，凡是有人通奸的，通奸双方都要被处死。在中国的礼法中，乳母是八母之一（嫡、继、养、慈、嫁、出、庶、乳）。郑经这样做，完全是违背了伦理道德。郑成功万万没有想到，如此伤风败德的事情竟然发生在自己的家里。知道这件事后，他急怒攻心，病情更为沉重。
五月八日，病入膏肓的郑成功，穿好明朝的官府端坐在椅子上，开始念太祖遗训，念到第三章的时候，他泪如雨下，悲痛地说：“自国家飘零以来，枕戈泣血，十有七年，进退无据，罪案日增，今又屏迹遐荒，遽捐人世，忠孝两亏，死不瞑目，天乎天乎！”说完这句话，他激动地顿足抓头（另一说为抓面），近乎疯狂状态，不久就倒地身亡了。壮志未酬身先死，长使英雄泪满襟。悲剧英雄郑成功的一生有太多的遗恨。