不过两人之间也曾发生过一次小冲突，有一天，马皇后问朱元璋，老朱你那么厉害一统天下，现如今也不打仗了，听说家家户户也都分到了田安心种地，不知道老百姓现在过得怎么样，能不能吃饱饭了。朱元璋一听这话，立刻警惕起来，皇后询问天下百姓过得怎么样，这是想要干政啊，但既然皇后问了，总得有个回答吧，于是朱元璋对马皇后说，这不是你应该问的问题。马皇后一听就知道老朱又敏感了，随后就开始敲打起了老朱，说道：“陛下天下父，妾辱天下母，子之安否，何可不问！”马皇后话里有话，一方面体现出马皇后爱民如子，另一方面则是告诉朱元璋，我知道你心里在想什么，你不就是怕我干政吗？但本后要提醒你，关心黎民百姓不只是出于政治上的，更是出于情感道德上的，不仅打消了朱元璋的胡思乱想，也从法理层面确立了她对政事有限的干预所具备的合法性。
马皇后的爱民如子不仅仅只是嘴上说说，也体现在实际行动上，每当百姓遇到灾年，马皇后就率领后宫吃粗茶淡饭，节省开支（朱元璋时代的公务员真不容易），并为百姓祈福，尽管这种行为对缓解灾荒没多大用处，但首先作为帝制时代的皇后，她这样做已经是尽最大努力了，其次，她营造的同甘共苦的舆论氛围最大程度降低了百姓因为吃不饱饭而可能对统治者产生的不满情绪。朱元璋是一个疼老婆的男人，看到马皇后都不吃饭了，特别心疼，他开导马皇后的方法也很有趣，竟然是对马皇后说已经派人前去赈灾了，皇后不必如此苦着自己，马皇后手眼通天，还不知道朱元璋的伎俩嘛，但是夫妻相互关爱真的很有爱。