此时情况与直皖战争、第一次直奉战争时已经全然不同，当时的直系处于皖系、奉系压迫之下，众志成城，在接连击败皖系和奉系之后，直系掌握北京政权，便自以为天下之势尽在掌握，直系诸将早已是各自为政。吴佩孚此番入京，心知直系诸将万难如从前那般受他调用，旧将难遣，新兵则羽翼尚未丰满，而奉系大军压境，后勤又没有保障，吴佩孚对于眼前这一战实在没有取胜的把握。
但此时大战在即，曹锟又连番致电，纵然是“巧妇难为无米之炊”，也只能硬着头皮上炉灶了。1924年9月17日，吴佩孚乘专车入京，方其入京之日，沿途以隆重的礼节欢迎，自车站到总统府亦是五步一哨、十步一岗，直系大将冯玉祥、王承斌、王怀庆等亲自列队恭候大驾。曹锟见到吴佩孚，内心便稳当了很多，直系诸将更是对吴佩孚毕恭毕敬。后来有史学家认为，正是因为这一派“兄弟阋于墙，而外御其侮”的和谐氛围，让吴佩孚误以为大战当前直系军阀会空前团结，随后才会掉以轻心。其实从吴佩孚随后冒险起用根本就不够成熟的海军来看，吴大帅不仅没有被这个场面唬住，反而是更加意识到了事态的严重性。在那个战争依靠步兵决定胜负的年代，起用水兵显然是一件极为冒险的事情，更何况还是吴佩孚不熟悉的海军，还是他非常不了解的海军主帅，若非是碰到了实难解决的难题，秀才出身的吴佩孚万不可能选择铤而走险。