在阿里巴巴的绩效考核体系中，员工的价值观与业绩各占50%的权重。员工通过考核被分成三种：有业绩但价值观不相符的，被称为“野狗”；事事老好人、但没有业绩的，被称为“小白兔”；有业绩也有团队精神的，被称为“猎犬”。
对于员工的职业生涯发展，阿里巴巴很早就规划出管理和业务两大通道。2004年，阿里巴巴又对晋升通道进行了系统完善，管理序列设置M1～M8共8个节点，专业序列设置P1～P6共6个节点，5000名员工全部规划到14个节点之中。
2006年底，阿里巴巴进行了一次机构大调整，将各业务部门独立出来，成立了5个全资子公司：阿里巴巴、淘宝、支付宝、雅虎中国和阿里软件，江湖人称“达摩五指”。这种调整在跨国公司中可能要经历半年的痛苦过程，然而在阿里巴巴仅两个月就完成了，其间简单透明的企业文化发挥了重大作用。